1. Transcription Factor
1) General Transcription Factor
- 단백질을 암호화 하는 모든 유전자들의 전사에 필수적인 전사인자이다.
- promoter 및 promoter의 TATA box 등에 결합하거나 RNA polymerase에 결합한다.
2) Specific Transcription Factor
- 특정 시기나 특정 장소에서 발현되기 위해 필요한 전사인자이다.
- 조절요소와 결합하여 유전자 발현을 조절한다.
- 활성자(activator)와 억제자(repressor)가 있다.
2. Transcription Control Element
전사를 촉진하는 경우 enhancer, 억제하는 경우 silencer라고 부른다.
1) Proximal Control Element
- promoter와 근접한 곳에 있다.
- Linker scanning mutation 실험
- HSV-I의 타이미딘 kinase 유전자(tk)의 proximal control element 확인
2) Distal Control Element
- promoter로 부터 멀리 떨어져 있다.
- promoter의 상부(upstream)에 위치할 수도 있고 하부(downsteam)에 위치할 수도 있다. exon이나 intron 내부에 있는 경우도 있다. 예) Pax6 유전자
3. 조절 과정
- activator protein(혹은 repressor protein)이 distal regulatory factor에 결합한다.
- DNA 굽힘 단백질에 의해 activator가 promoter에 근접한다.
- activator가 매개자 단백질들, GTFs 및 RNA polymerase와 결합하여 전사 개시 복합체를 형성한다. 일부 활성자와 억제자는 직접적으로 전사에 영향을 줄 뿐만 아니라 간접적으로 염색질 구조에 영향을 준다. 효모와 동물세포를 이용한 실험에서 일부 활성자는 특정 유전자의 promoter 주위에 히스톤을 아세틸화시키는 단백질을 끌어와 히스톤을 아세틸화시켜 해당 유전자의 전사를 촉진한다는 사실이 알려졌다. 이와 유사하게 일부 억제자는 히스톤을 탈아세틸화시키는 단백질을 끌어와 유전자 침묵(silencing)으로 알려진 전사 감소 현상을 일으킨다. 실제 진핵생물에서는 염색질-변형 단백질의 동원이 가장 보편적인 전사 억제 기작이다.